What does Gene Ontology means?
Gene Ontology หมายถึงการกำหนดคำศัพท์ควบคุม เพื่อใช้ในการอธิบายถึง gene และ gene product ที่เป็นเอกลักษณ์ในทุกๆระบบของสิ่งมีชีวิต สามารถแยกข้อมูลโดยรวมได้เป็นสองส่วน คือ
1. Ontology itself คือ การบ่งชี้ถึงแนวคิดสำคัญในการแสดงข้อมูลทาง Molecular biology ซึ่งข้อมูลในส่วนนี้มีการปรับปรุงอยู่อย่างต่อเนื่อง
2. annotation คือ การแสดงลักษณะของ gene product โดยใช้คำศัพท์ควบคุมที่มีอยู่ในข้อกำหนดของ ontology ข้อมูลทั้งหมดจะมาจาก Go Consortium ซึ่งกลุ่มสมาชิกนี้จะเสนอข้อมูลอย่างเปิดเผย บุคคลทั่วไปสามารถสืบค้นได้ผ่าน GO website
ในทางชีวเคมีกรณีที่มีผู้สนในทำการศึกษาเป็นส่วนของแนวคิดทาง Molecular biology ซึ่งเป็นแนวคิดที่มีวัตถุประสงค์สำคัญ คือ เพื่อสร้างคำศัพท์ที่ใช้ควบคุม และเป็นข้อกำหนดร่วมที่สามารถนำไปประยุกต์ใช้กับสิ่งมีชีวิตทั้งหมด โดยอาศัยพื้นฐานความรู้ที่สอดคล้องกันในเรื่องของ บทบาทหน้าที่ของ ยีน และโปรตีนภายในเซลล์ ซึ่งมีการสะสมข้อมูลของการทำงาน และสามารถเปลี่ยนแปลงได้
ลักษณะการจัดข้อมูลเบื้องต้นของ Gene Ontology ในเชิง molecular biology เป็นอย่างไร?
Gene Ontology (GO) ในส่วนนี้มีการทำให้เป็นระบบ โดยอาศัยลักษณะบ่งชี้สำคัญคือ
1. Molecular function (MF) ซึ่งอธิบายถึงลักษณะกิจกรรมเฉพาะ ผ่านทางคุณสมบัติที่เป็นเอกลักษณ์ของสารที่ได้จากยีน โดยการเปลี่ยนแปลงทางเคมี เช่น transcription factor และ ATPase activity
2. Biological process (BP) ซึ่งกล่างถึงบทบาทที่เด่นชัดทางชีววิทยา เช่น mitosis และ purine metabolism เป็นต้น
3. Cellular component (CC) เป็นการอธิบายถึงโครงสร้างในระดับที่เล็กกว่าเซลล์ ตำแหน่ง และส่วนประกอบของโมเลกุลขนาดใหญ่ เช่น nucleus และ origin recognition complex
สมัครสมาชิก:
ส่งความคิดเห็น (Atom)
ไม่มีความคิดเห็น:
แสดงความคิดเห็น